1947年7月11日，黄县县委、县政府在黄县城召开村支部书记以上的干部会议，传达贯彻了上级指示精神，全面部署深入开展复查工作。会议提出了“树立贫雇农领导优势，一切大权归农会”的口号。随着《七七指示》的贯彻，全县复查运动中“左”的倾向更加日益严重起来。为了贯彻贫雇农路线，让贫雇农掌握土改复查的领导大权，黄县农村再次开展了党的支部及各群众组织的整顿建立工作。首先整顿村党支部。在学习讨论“为什么要树立贫雇农领导优势”之后，支委成员要在全体党员会上汇报过去自己工作的情况，开展批评与自我批评，然后结合审查阶级成分情况，清洗出所谓党内异己分子，解除党支部中中农成分的支委职务。据统计，黄县7个区共清洗出所谓阶级异己分子和解除党支部内中农成分的支委330名。因支部成员中中农成分占多数而被解散的党支部就有38个。与此同时，突击发展了大批贫雇农党员，大量地提拔贫雇农成分的新党员为支委成员。另据8个区的统计，这一阶段共发展新党员1609名，其中贫雇农成分的党员1170人。经过整顿之后的村党支部，贫雇农成分占了绝对优势。新的村党支部建立后，即开始建立、整顿各群众组织。首先召开贫雇农会议，在诉苦、审查阶级成分的基础上，成立贫雇农小组(亦称贫农团)，然后由贫雇农小组讨论选举出农民翻身代表，组成村农民翻身委员会。该委员会完全由贫雇农组成，负责领导全村的复查工作及其他党政军民等各项工作。农会成了村中最高权力机关。 7月中旬，黄县在农民翻身委员会的领导下，各村开展了向地主阶级的清算活动。其主要做法有二：一是在经济上“封门倒筒”。各村几乎在同一个时间封了地主富农(包括部分中农)的家门，将其全家人口“扫地出门”，没收其全部财产。与此同时，还号召其他富裕户献房、献地、献东西。二是在政治上进行批判斗争，加强管制。各区、村都普遍地召开了规模不同的斗争会。引导贫雇农刨穷根、吐苦水，向地主富农追浮财、要金银。声势较大的一次斗争会是7月25日城西区16个村庄的2000多农民，在城西松岚村联合召开的算账斗争大会。这次对地主批判斗争大会之后，各区、村都采取了措施，加强了对地主的管制。有的区召开“庆祝翻身，受降地主大会”，让地主等人在保证书上签字画押；有的区在全体农民大会上表决通过管制法，号召群众监督地主执行。如黄县城北区的管制法中就有以下的规定：(一)禁止地主恶霸法外行动。(二)罚处地主恶霸服劳役。(三)不准地主恶霸吃好饭。(四)地主见到穷人要低头，并要服从农会领导。(五)农会武装中，设地主恶霸管制小组，专门代表农民管理地主恶霸。地主恶霸必须服从管制小组命令，不得违抗。(六)地主恶霸必须立即具结画押，痛改前非。(七)地主恶霸犯罪逃跑时全家连坐。(八)地主恶霸如违犯管制法，轻者处罚，重者枪毙等。在这次清算中存有两个突出的问题：一是各村普遍存有挖“黄货(黄金)”的思想，只注重追浮财，而忽视了要土地。二是开始出现乱打人、乱杀人现象。据统计，黄县在第二阶段中有17人在斗争中被打死。
继黄县之后，海阳、蓬莱、长山岛、掖县、掖南、招远、招北、莱东和莱阳等县，也都开始了第二阶段的土改复查。7月，海阳县开始在全县开展土改复查工作。至10月底，共计批斗地主801户、富农866户、特务155人、恶霸20人，没收土地29万余亩、房屋9000余间、山峦3.5万亩、粮食26.2万斤，大牲畜3771头、银元26316元、金银15727两。由于受“左”的错误影响，运动中犯了扩大化错误，侵犯了部分中农的利益，出现了乱打、乱杀的现象。7月8日至17日，蓬莱县委召开6000人参加的农民代表大会，发动在全县进行土改复查运动。至7月底，全县初步树立了贫雇农的领导优势，239个村成立了新农会，斗争1452人，打死斗争对象120人，挖出特务55人。如此“左”的做法，竟被华东局批评为右倾。8月，蓬莱县委改变了原先提出的一些正确的政策，强调要彻底克服“富农路线”问题，又出现了更为严重的乱打、乱杀现象。12月3日，根据胶东区党委的指示精神，蓬莱县土改复查运动停止。至此，全县共有621个村、55243户、13.8万人参加了土改复查运动；斗争果实是复查出土地14.1万亩，粮食730万斤，房屋4.54万间，牲口5015头，农具12.5万件，衣服36.8万件，黄金711两，白银2.3万两，银元30581元，北海币2794万元，其他物资折价8.72亿元。有35317户、14.2万人分到斗争果实。在长山岛,7月上旬，长山岛特区工委召开会议，在各村成立贫雇农小组，并把权力交给他们。从下旬开始，各区普遍召开贫雇农大会，批判“富农思想”，“改造各级领导”。 8月运动进入高潮。在运动中，斗争了封建渔霸、地主、富农，也斗争了一部分中农，没收了他们的船、网、土地和房屋，分给了贫苦群众，同时处死了一批斗争对象。
